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瑞沃德單細(xì)胞懸液制備儀讓皮膚單細(xì)胞測序變得簡單

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行業(yè)資訊
  • 2023-02-21

  • 來源:瑞沃德

  • 瀏覽量:4615

作為哺乳動物最大的器官,皮膚是動物與外界環(huán)境間最主要的物理屏障;由于生活習(xí)性和所處的外界環(huán)境不同,皮膚的功能和表面的微生物組成等都會發(fā)生變化。同時,皮膚又是獨特的免疫器官,在維持穩(wěn)態(tài)和抵抗各種病理條件時,發(fā)揮獨特的免疫功能。皮膚組織內(nèi)包含如朗格漢斯細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、樹突細(xì)胞等多種免疫細(xì)胞。在單細(xì)胞測序應(yīng)用領(lǐng)域,研究者往往需要對皮膚組織內(nèi)的不同細(xì)胞亞群進(jìn)行分類,并在不同疾病模型下定位靶細(xì)胞,同時在進(jìn)行腫瘤類研究時(如黑色素瘤和鱗狀細(xì)胞癌等)也需要對腫瘤亞型及細(xì)胞的識別。

只有制備高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液才能保證下游實驗的順利進(jìn)行,但是常規(guī)手工解離皮膚組織,不但費時,且獲得的細(xì)胞懸液碎片高,產(chǎn)量低,同時還易結(jié)團(tuán),細(xì)胞活性差,嚴(yán)重影響下游研究的開展,如單細(xì)胞測序。因此在進(jìn)行皮膚組織單細(xì)胞懸液制備時,需要更加簡單快捷的方法,在提高實驗效率同時,又能保證實驗樣本的質(zhì)量。

瑞沃德單細(xì)胞懸液制備儀,通過組織處理管機械剪切,配合酶解試劑盒和內(nèi)置的處理程序及溫控系統(tǒng),只需將樣本放入,設(shè)好程序,即可輕松獲得高質(zhì)量皮膚單細(xì)胞懸液,獲得的細(xì)胞可直接用于后續(xù)實驗,如單細(xì)胞測序、原代細(xì)胞培養(yǎng)、細(xì)胞分選等。

有了高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液后,高效穩(wěn)定且高性價比的單細(xì)胞測序平臺將保障下游實驗結(jié)果的質(zhì)量與大規(guī)模應(yīng)用的可能。達(dá)普生物Galaxy單細(xì)胞建庫平臺基于專利的微流控油包水單細(xì)胞包裹技術(shù)與微球編碼配套技術(shù),可快速實現(xiàn) 1-4 樣本的單細(xì)胞測序文庫構(gòu)建。經(jīng)過生信分析軟件 StarScope處理后,表達(dá)矩陣結(jié)果兼容幾乎所有下游生信分析軟件,輕松得到單細(xì)胞測序?qū)嶒灁?shù)據(jù)。

下面為大家展示一下,瑞沃德單細(xì)胞懸液制備儀和達(dá)普生物單細(xì)胞建庫平臺無縫對接的樣本制備與單細(xì)胞建庫測序結(jié)果。

單細(xì)胞懸液制備

樣本:小鼠耳部皮膚、背部皮膚。

制備方法:

1. 試劑準(zhǔn)備

使用試劑盒中配套的Buffer將酶A、B、C分別充分溶解。

2. 樣本準(zhǔn)備

將剪下的小鼠背部皮膚置于冷PBS緩沖液中,用手術(shù)剪或手術(shù)刀的閉合圓邊尖端分離皮膚樣本后清洗3遍;耳部皮膚去除無毛部分,用鑷子將背腹側(cè)分開,用鑷子輕輕刮耳朵內(nèi)側(cè),去除殘留軟骨,然后將皮膚切成約1cm2的組織塊。

小鼠背部皮膚處理前后

小鼠耳部皮膚處理

3. 程序處理

將組織塊和酶mix放入組織處理管,安裝加熱套,運行加熱程序 “M_Skin_Heater_1”。

4. 單細(xì)胞懸液收集

程序運行結(jié)束后,用潤濕后的40 μm細(xì)胞濾器過濾細(xì)胞懸液樣本,50 mL離心管收集細(xì)胞懸液,500×g離心8min,徹底棄掉上清后,用適當(dāng)緩沖液重懸后用于單細(xì)胞測序、流式細(xì)胞術(shù)或原代細(xì)胞培養(yǎng)等。

測試結(jié)果

小鼠耳部皮膚

小鼠背部皮膚

單細(xì)胞測序結(jié)果

達(dá)普生物先對上述懸液進(jìn)行成像質(zhì)檢,并選取背部皮膚組織單細(xì)胞懸液,用其自主研發(fā)的Galaxy單細(xì)胞建庫平臺及配套的轉(zhuǎn)錄組試劑盒進(jìn)行單細(xì)胞建庫測序。

測序結(jié)果

1)達(dá)普StarScope軟件分析結(jié)果:

達(dá)普StarScope軟件分析結(jié)果

2) UMAP聚類分析:

與發(fā)表文獻(xiàn)對比,所有細(xì)胞類群能夠mapping,比例高度相似,并且線粒體基因百分較低,證實利用達(dá)普Galaxy 對皮膚組織樣本單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序的可行性及瑞沃德單細(xì)胞懸液制備儀解離的皮膚組織樣本可直接對接達(dá)普Galaxy單細(xì)胞建庫系統(tǒng)。

UMAP圖

Reference:A Single Cell Transcriptomic Atlas Characterizes Aging Tissues in the Mouse

以上單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄測序結(jié)果顯示:通過瑞沃德自動單細(xì)胞懸液制備系統(tǒng)制備的皮膚組織樣本可以直接用于達(dá)普Galaxy單細(xì)胞建庫平臺,不但縮短樣本懸液制備時間,同時高質(zhì)量的懸液質(zhì)量,減少了單細(xì)胞建庫過程中樣本優(yōu)化及減少一些碎片對反轉(zhuǎn)錄的影響,保證了建庫質(zhì)量,整體上縮減了整個單細(xì)胞建庫測序周期, 驗證了瑞沃德與達(dá)普Galaxy產(chǎn)品的高兼容性。

實驗使用產(chǎn)品

瑞沃德單細(xì)胞懸液制備儀

瑞沃德單細(xì)胞懸液制備儀  11.jpg

1.標(biāo)準(zhǔn)流程,提高實驗可重復(fù)性

2.可配置加熱套實現(xiàn)自動樣品處理

3.多通道獨立工作,可同步處理不同組織,節(jié)約實驗時間

4.一機兩用,同時可進(jìn)行組織勻漿

Galaxy星海單細(xì)胞測序建庫系統(tǒng)

Galaxy星海單細(xì)胞測序建庫系統(tǒng)

1.性能優(yōu):可一次性完成數(shù)百至數(shù)萬個細(xì)胞的分離,基因檢測靈敏度高。

2.上樣活:1-4 通道,可靈活選擇樣本數(shù)及細(xì)胞數(shù)量,方便快捷。

3.兼容好:文庫兼容 主流國產(chǎn)與國外測序平臺。

4.分析全:自主開發(fā)的 StarScope 生信分析軟件,可完成從原始數(shù)據(jù)到分析報告的生信分析。

5.流程活:可接駁下游流程 ,如單液滴分選。

瑞沃德 & 達(dá)普生物強強聯(lián)合

瑞沃德與達(dá)普生物在單細(xì)胞測序市場的業(yè)務(wù)上下游互補關(guān)系,瑞沃德在單細(xì)胞懸液制備領(lǐng)域沉積多年經(jīng)驗并組建了龐大的研發(fā)團(tuán)隊,推出了單細(xì)胞懸液制備儀及配套試劑盒, 其可快速對組織樣本進(jìn)行高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液制備,上市以來廣受客戶好評,有效解決了單細(xì)胞測序中的前端組織樣本單細(xì)胞懸液制備難題,為單細(xì)胞測序建庫提供前期保障,瑞沃德與達(dá)普生物雙方強強聯(lián)合,致力于打通單細(xì)胞測序上測序儀之前的各環(huán)節(jié)關(guān)卡,保證單細(xì)胞測序質(zhì)量,共同深耕單細(xì)胞測序領(lǐng)域。