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揭示細(xì)胞外排磷酸鹽機(jī)制,探索人體磷酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)深層機(jī)密——Nature一作顏芮

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行業(yè)資訊
  • 2024-11-28

  • 來源:RWD

  • 瀏覽量:2458

今年8月,中國科學(xué)院物理研究所/北京凝聚態(tài)物理國家研究中心軟物質(zhì)與生物物理實(shí)驗(yàn)室SM10組特聘研究員姜道華團(tuán)隊(duì),通過冷凍電鏡單顆粒技術(shù)重構(gòu)出磷酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白XPR1處于不同構(gòu)象的高分辨率結(jié)構(gòu),首次揭示了XPR1外排磷酸根離子的門控機(jī)制和SPX結(jié)構(gòu)域的調(diào)控機(jī)制。相關(guān)研究成果以Human XPR1 structures reveal phosphate export mechanism為題,發(fā)表在《自然》(Nature)上。研究發(fā)現(xiàn),XPR1的結(jié)構(gòu)類似于轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,但采取新穎的類似于通道的門控機(jī)制外排磷酸根,不同于大多數(shù)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白采用的交替開放的轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制。同時(shí),該研究首次闡明了SPX結(jié)構(gòu)域通過結(jié)合多磷酸肌醇調(diào)節(jié)XPR1的通量,提出了多磷酸肌醇感知和磷酸跟輸出之間的耦合機(jī)制。上述成果對(duì)人體磷酸根穩(wěn)態(tài)研究至關(guān)重要。

揭示細(xì)胞外排磷酸鹽機(jī)制,探索人體磷酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)深層機(jī)密——Nature一作顏芮

揭示細(xì)胞外排磷酸鹽機(jī)制,探索人體磷酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)深層機(jī)密——Nature一作顏芮

您和團(tuán)隊(duì)今年8月份在Nature上發(fā)表了一篇關(guān)于XPR1蛋白結(jié)構(gòu)及其在磷酸鹽出口中作用的文章,能和我們簡(jiǎn)單介紹一下文章和實(shí)驗(yàn)的思路嗎?

顏芮:在獲得該蛋白質(zhì)樣本后,我們將首先通過文獻(xiàn)調(diào)研來掌握當(dāng)前的研究動(dòng)態(tài),并深入探討其生物學(xué)功能以及結(jié)構(gòu)與功能之間的聯(lián)系。我們所研究的蛋白質(zhì)大多與藥物開發(fā)和疾病治療相關(guān),目標(biāo)是為人類健康做出貢獻(xiàn)。實(shí)驗(yàn)流程將遵循標(biāo)準(zhǔn)的蛋白質(zhì)研究方法,包括路徑選擇、基因構(gòu)建、蛋白純化、樣品制備、數(shù)據(jù)分析以及功能驗(yàn)證等關(guān)鍵步驟。

揭示細(xì)胞外排磷酸鹽機(jī)制,探索人體磷酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)深層機(jī)密——Nature一作顏芮

那XPR1蛋白在人體內(nèi)扮演的角色是怎樣的呢?

顏芮:無機(jī)磷酸鹽(Pi)是所有生物體必需的常量營養(yǎng)素,它參與了幾乎所有的生物過程,包括物質(zhì)合成、呼吸作用、光合作用、能量轉(zhuǎn)換和信號(hào)傳導(dǎo)等關(guān)鍵生理活動(dòng)。生物體內(nèi)的磷酸鹽水平受到精細(xì)的調(diào)控,因?yàn)槠浜康牟蛔慊蜻^剩都可能引發(fā)疾病,例如心功能障礙、佝僂病、骨軟化癥和血管鈣化等。XPR1是人體中已知的唯一負(fù)責(zé)磷酸鹽外排的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,其功能異常與人類神經(jīng)系統(tǒng)疾病如原發(fā)性家族性腦鈣化和腎范可尼綜合征有關(guān)。

這篇文章中,您運(yùn)用了包括冷凍電鏡、基因克隆和蛋白表達(dá)、細(xì)胞培養(yǎng)、蛋白質(zhì)純化、蛋白免疫印跡在內(nèi)的多種實(shí)驗(yàn)技術(shù)。在一系列過程中,哪一種技術(shù)/設(shè)備給您留下了最深刻的印象?

顏芮:我們的實(shí)驗(yàn)和操作都離不開先進(jìn)的平臺(tái)和儀器支持。在基因構(gòu)建和提取階段,我們主要依賴PCR儀,這是基礎(chǔ)且至關(guān)重要的設(shè)備。接下來是離心機(jī)的使用,幾乎所有實(shí)驗(yàn)都離不開離心步驟。離心機(jī)的穩(wěn)定性、溫度控制、轉(zhuǎn)速和離心時(shí)間對(duì)我們實(shí)驗(yàn)的順利進(jìn)行至關(guān)重要。在這方面,瑞沃德品牌的離心機(jī)表現(xiàn)出色。

然而,我認(rèn)為最便捷的設(shè)備是細(xì)胞計(jì)數(shù)儀。每次細(xì)胞傳代和表達(dá)都需要精確控制細(xì)胞濃度。傳統(tǒng)的細(xì)胞計(jì)數(shù)板操作不僅耗時(shí),而且結(jié)果不夠穩(wěn)定。自從我們開始使用瑞沃德的細(xì)胞計(jì)數(shù)儀后,它能迅速且準(zhǔn)確地提供細(xì)胞狀態(tài)、數(shù)量和存活率等關(guān)鍵數(shù)據(jù),極大地提高了我們的工作效率,并且結(jié)果直觀易懂。

揭示細(xì)胞外排磷酸鹽機(jī)制,探索人體磷酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)深層機(jī)密——Nature一作顏芮

了解到您的實(shí)驗(yàn)室中用了很多瑞沃德的設(shè)備,您對(duì)于我們的整體印象是怎樣的呢?

顏芮:瑞沃德的產(chǎn)品整體性能非常出色,尤其是我最近使用的冷凍離心機(jī)。我們之前使用的進(jìn)口離心機(jī)最大轉(zhuǎn)速僅為13000rpm,而瑞沃德的離心機(jī)最大轉(zhuǎn)速可達(dá)到15800rpm,超過我們現(xiàn)有的進(jìn)口設(shè)備,這讓我感到非常驚喜。

在質(zhì)量方面,目前我沒有遇到任何重大問題,公司的售后服務(wù)也很到位,設(shè)備運(yùn)行非常順利。此外,我覺得瑞沃德的產(chǎn)品設(shè)計(jì)獨(dú)具特色,外觀以灰白色為主,既美觀又實(shí)用。

揭示細(xì)胞外排磷酸鹽機(jī)制,探索人體磷酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)深層機(jī)密——Nature一作顏芮

那對(duì)于包括瑞沃德在內(nèi)的國產(chǎn)設(shè)備品牌,您是怎么看待的?

顏芮:在價(jià)格方面,國產(chǎn)設(shè)備具有明顯的競(jìng)爭(zhēng)力,它們提供了高性價(jià)比的選擇。此外,國產(chǎn)設(shè)備的交貨時(shí)間相對(duì)較短,購買后能迅速收到所需設(shè)備,這與進(jìn)口設(shè)備相比,后者往往需要較長的國際運(yùn)輸時(shí)間。國產(chǎn)設(shè)備在售后服務(wù)方面也做得非常好,任何問題都能得到及時(shí)響應(yīng)、高效解決。

實(shí)際上,大多數(shù)國產(chǎn)設(shè)備在使用體驗(yàn)上與進(jìn)口設(shè)備相差無幾,甚至在某些情況下能夠提供同等或更好的性能。因此,我們當(dāng)然更傾向于支持國產(chǎn)設(shè)備,它們不僅能夠滿足我們的需求,還能促進(jìn)國內(nèi)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。

揭示細(xì)胞外排磷酸鹽機(jī)制,探索人體磷酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)深層機(jī)密——Nature一作顏芮

之前我們也采訪過你們同課題組發(fā)Nature文章的武迪博士,大家對(duì)你們的導(dǎo)師姜道華教授的評(píng)價(jià)都很高。

顏芮:是的,我真的非常幸運(yùn)能遇到現(xiàn)在的導(dǎo)師,姜老師除了帶領(lǐng)我們拿到成績(jī),也很注重我們個(gè)人自身的成長。他會(huì)以老師的角度去告訴我們,從學(xué)生的自身出發(fā),怎么做才能得到一個(gè)更好的結(jié)果。一開始來這個(gè)課題組的時(shí)候,因?yàn)槊恐芏家_組會(huì)很煩惱,開了幾次之后我就非常期待每周的組會(huì)了,姜老師會(huì)不厭其煩地逐頁去分析和校正你的PPT,幫你捋邏輯,告訴你怎么處理會(huì)更好,我們就是在這個(gè)過程中慢慢地進(jìn)步。

而且老師也非常強(qiáng)大,他可以同時(shí)把握我們課題組每一個(gè)人的課題和進(jìn)度,重點(diǎn)抓得非常準(zhǔn),真的是非常厲害又負(fù)責(zé)的老師,非常感謝他。

那您是早就想好要從事科研,還是在后來的過程中被導(dǎo)師影響,一步一步走到現(xiàn)在的?

顏芮:我碩士學(xué)的是農(nóng)業(yè)微生物,可以說跟結(jié)構(gòu)蛋白毫不相關(guān),操作基本都不會(huì)。碩士畢業(yè)后我沒想要做科研,并不是我不愛做科研,而且當(dāng)時(shí)的方向我實(shí)在不習(xí)慣,然后又沒有一個(gè)明確的博士方向,我就沒繼續(xù)讀了。畢業(yè)后去了微生物所做助理工程師,當(dāng)時(shí)他們剛好招應(yīng)屆生,給了編制也解決北京戶口就去了。中科院的學(xué)生素質(zhì)會(huì)更偏向科研方向,在那個(gè)環(huán)境里覺得大家都好厲害,自己像菜鳥誤入高端局,非常迷茫。呆了一年多,我就決定放棄了編制,來到了姜老師這邊,也慢慢被老師的專業(yè)和人格魅力所打動(dòng),堅(jiān)定地長久地選擇了科研這條路。

在這個(gè)過程中,有什么特別艱難的時(shí)刻嗎?又是怎么走過來的?

顏芮:其實(shí)所有的苦難都源于自己的能力不足。因?yàn)榭蒲斜尘跋嗖畋容^大,我當(dāng)時(shí)到課題組的時(shí)候就是一個(gè)小白,很多東西包括軟件操作也不會(huì),要補(bǔ)充很多知識(shí),做很多實(shí)驗(yàn),老師也比較嚴(yán)格,對(duì)大家期望高,那時(shí)候壓力就會(huì)比較大。但老師會(huì)給你時(shí)間,給你犯錯(cuò)誤的機(jī)會(huì),在這個(gè)過程中一點(diǎn)一點(diǎn)地成長起來。

擺正心態(tài)是一件非常重要的事情,對(duì)于我來說,想要做成這件事情,就不要管過程中的困難,不要去想別人怎么這么厲害、我怎么這么弱。要接受大家的背景和能力本來就不同,首先要接納和認(rèn)可自己,今天的自己比昨天的自己進(jìn)步就好了。如果周圍的人都和你差不多,那可能也不會(huì)有太多的進(jìn)步??倳?huì)有人更強(qiáng),那就向強(qiáng)者學(xué)習(xí),遇強(qiáng)則強(qiáng),這樣的環(huán)境才能不知不覺地成長起來。

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